Un pilar fundamental para la implementación y operación del CEMUHI es la conformación de una red regional con todos los actores involucrados en la cuenca del Alto Atoyac (organizaciones sociales e instituciones) para coadyuvar a atender las problemáticas prioritarias del río y promover su importancia en los ámbitos gubernamentales de todos los niveles, así como en los sectores privado, social y académico; e incrementar la capacidad local para abordar los retos y problemas del río a través de la coordinación e interacción directa con expertos de otras regiones del país. Las redes de colaboración entre empresas, organizaciones de la sociedad civil, gobierno, academia y la sociedad en general tendrán como propósito la implementación conjunta de acciones encaminadas a la disminución de la contaminación e incrementar la calidad del agua del río Atoyac, la promoción de actividades culturales y recreativas que sensibilicen a la población sobre la problemática y posibles soluciones para su saneamiento; y el involucramiento de la comunidad, que busque el beneficio de su entorno, específicamente del río Atoyac, y se fomente la comunicación y la sana relación de la sociedad, de tal forma que se logre fortalecer el tejido social.
Las redes de vinculación que surjan como resultado del trabajo conjunto de los socios CEMUHI podrán ser con los siguientes enfoques:
Proyectos de investigación orientados a atender la problemática ambiental, económica, social y de salud como resultado de la contaminación del río Atoyac.